۳ مطلب در فروردين ۱۳۹۴ ثبت شده است

آزمایش مزلسول-استال(meselson-stahl)

replication ویا همانند سازی DNA نتایج جالبی را طی سالیان درازی که دانشمندان برروی آن آزمایش کردند را نشان داده است.آزمایش متیو مزلسون وفرانکلین استال که در سال 1958 انجام شد یکی از این آزمایش هاست. در این آزمایش به بررسی DNA semiconservative ویا DNA نیمه حفظ شده در باکتری E.coli پرداخته شد.

شرح آزمایش:

در حالت طبیعی باز های موجود در مولکول DNA دارای نیتروژن سبکN14 ویا light می باشند.برای بررسی این آزمایش و مشخص شدنDNA دختری و والدی یک قطعه از DNA باکتری E.coli در محیط کشت حاوی نیتروژن سنگینN15 ویاHeavy که در حالت طبیعی در طبیعت وجود ندارد قرار داده شد.پس از14 نسل DNA حاوی نیتروژن سبک به DNA حاوی نیتروژن سنگین تبدیل شد.

 بعد از این مرحله باعمل سانتریفیوژ  غلظت DNA Heavy مشخص کردید. سپس این DNA درون محیط کشت حاوی نیتروژن سبک قرار گرفت ومیزان غلظت آن با عمل سانتریفیوژ طی هر نسل مورد بررسی قرار گرفت.

نتایج:

در نسل اول 100 درصد DNA موجود در محیط به صورت نیمه حفظ شده یعنی حالت میانه از لحاظ غلظتی قرار گرفت که در این حالت یک رشته از DNA حاوی نیتروژن سبک(رشته دختری)  ویک رشته از DNA حاوی نیتروژن سنگین(رشته مادری) بود.به این ترتیب DNA نیمه حفاظتی مورد بررسی قرار گرفت.

۲۹ فروردين ۹۴ ، ۱۰:۲۴ ۴ نظر موافقین ۰ مخالفین ۰
genetic 1994

سریع حساب کن!

سلام

بعضی وقتا توحساب کردن چنتا ضرب وتقسیم معمولی میمونی و گیج میشی این اتفاق واسه خود منم زیاد افتاده اما همیشه دوست داشتم یه روش راحت یه جور دورزدن قوانین ریاضی رو وارد بودم تا حداقل توحسابای روزمرم سریع تر باشم.


ریاضی


امروز میخوام یه کتاب فوق العاده کاربردی روبهتون معرفی کنم که واقعا مارو از ضرب و تقسیم های طولانی نجاتمون میده وکلا دیدمون رو نسبت به ریاضیات عوض میکنه.


کتاب روش سریع در حساب تراختنبرگ

 

تراخنبرگ


روش یاکوف تراختنبرگ روشی برای محاسبه سریع مسائل پایه ریاضی است.این روش ها را زمانی که او در زندان نازی ها اسیر بود کشف نمود.این روش ها شامل چند الگوریتم ساده انجام محاسبات است که فرد باتمرین وبه خاطر سپردن آن می تواند مسائل پایه ریاضی را به راحتی حل نماید


تراختنبرگ در سال ۱۹۵۰ مؤسسه ریاضی زوریخ را بنا نهاد که صبح‌ها شاگردان هفت الی هجده ساله و عصرها مردان و زنان مشتاق در سر کلاسهای درس حاضر می‌شدند و از سادگی روش تازه ریاضیات لذت می‌بردند.

تراختنبرگ معتقد بود علت اینکه اغلب ما در کار با اعداد مشکلاتی داریم دشوار بودن فهم حساب نیست، بلکه علت آن در روش کهنه‌ای نهفته‌است که با آن به ما درس داده‌اند. مزایای مهم روش محاسبهٔ ذهنی تراختنبرگ عبارتند از سهولت و سرعت و دقت بیشتر. او تا هنگام مرگ در سال 1953 به تدریس این روش همت داشت .

 

دانلود کتاب روش سریع تراختنبرگ در حساب



۲۰ فروردين ۹۴ ، ۲۰:۲۵ ۰ نظر موافقین ۱ مخالفین ۰
genetic 1994

!Real-Time PCR is the best

حقیقت اینکه برای یک ارائه در درس ژنتیک2 آماده میشم وموضوع تحقیقی من هم QPCR  یا Real-Time PCR هستش که یک روش بسیار جالب وکار آمد نسبت به روش PCR سنتی هست. لازم دیدم تا مطالبمو اینجاهم بنویسم شاید کسی بتونه استفاده کنه!


وجه افتراق Real Time PCR با PCR نوع معمولی به کار گرفتن یک نشانگر فلورسنت در واکنش جهت ردیابی محصول واکنش می باشد. این گزارش‌گرها به گونه‌ای طراحی می‌شوند که در صورت تکثیر DNA نور تولید کنند. لذا افزایش شدت نور ثبت شده در دستگاه با میزان محصول بدست آمده نسبت مستقیم دارد. به اولین چرخه‌ای که شدت فلورسنت بیشتر از خط پایه (Threshold)باشد چرخۀ آستانه یا CT گویند. عدد CT با مقدار الگوی اولیه رابطۀ معنی داری دارد و از روی آن می‌توان مقدار mRNA اولیه را تخمین زد.  به عبارت دیگر در فاز اولیه مرحله تصاعدی مقدار فلورسنت افزایش می یابد تا به آستانه­ای می رسد که به مقدارمشخصی از سطح background  بالاتر است، این چرخه ( سیکلی از PCR که قطعه تکثیر از حد آستانه عبور می کند) به عنوان CT شناخته می شود.
نمودار حاصل از تشعشعات فلورسنت

برای درج  نمودار تشعشعات فلورسنس یا به وسیله ی رنگ هایی مثل SYBER GREEN ویا پروب های DNA مثل TAQMAN که هر کدام به شیوه های مختلف به DNA ,CDNA وRNA متصل می شوند استفاده می گردد.

مزایای Real-Time PCR


* تکثیر می‌تواند در زمان- واقعی مانتیور شود.

* محصول PCR نیاز به پردازش های بعدی ندارد (ظرفیت پذیرش بالا و ریسک آلودگی پایینی دارد).

* چرخه‌های بسیار سریع (30 دقیقه تا 2 ساعت)

* محدوده پویایی آن1010 برابر بوده و نسبت به روش‌های سنجش سنتی RT-PCR (که  1000 برابر است) وسیع تر است.

* تشخیص با مقدار 2 برابر کمتر قابل انجام است.

* اثبات تکثیر مشخص از طریق آنالیز منحنی ذوب قابل انجام است.

* بسیار اختصاصی، حساس و تکرارپذیر است.

* نسبت به PCR سنتی زیاد گران‌تر از آب در نمی‌آید (البته به جزء قیمت دستگاه و تجهیزات آن)

معایب Real-Time PCR

* برای تکثیر چندتایی Multiplex PCR ایده‌آل نیست.

* نیاز به مهارت‌های تکنیکی و پشتیبانی قابل توجهی دارد.

* دستگاه و تجهیزات آن گران قیمت هستند.

* مشکلات مربوط به  RNA

* تفاوت‌های سنجشی

* آلودگی DNA (در آنالیز mRNA)


Daniel J.Park , PCR Protocols
Harry W.Janes ,Bing-Yuan.Chen , PCR CLoning Protocols
http://regenerativereview.com

۱۸ فروردين ۹۴ ، ۲۲:۳۸ ۱ نظر موافقین ۱ مخالفین ۰
genetic 1994